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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7sqkD_ | 8.00 | PDB header: cell cycle | Chain: D: PDB Molecule: isoform 4 of haus augmin-like complex subunit 4; |
Added to library: Sat Sep 24 13:48:45 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | P | C | N | L | S | K | E | D | L | L | Q | N | P | Y | F | S | K | L | L | L | N | L | S | Q | H | V | D | E | S | G | L | S | L | T | L | A | K | E | Q | A | Q | A | W | K | E | V | R | L | H | K | T | T | W | L | R | S | E | I | L | H | R | V | I | Q | E | L | L | V | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | B | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | Y | V | K | I | Q | D | T | N | V | T | S | E | D | K | K | D | F | V | W | M | R | A | R | L | Q | Q | E | V | E | E | Q | L | K | K | K | C | F | T | L | L | C | Y | Y | D | P | N | S | D | A | D | S | E | T | V | K | A | A | K | V | W | K | L | A | E | V | L | V | G | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | S | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Q | Q | Q | C | Q | D | A | K | S | Q | Q | K | E | Q | M | L | L | L | E | K | K | S | A | A | Y | S | Q | V | L | L | R | C | L | T | L | L | Q | R | L | L | Q | E | H | R | L | K | T | Q | S | E | L | D | R | I | N | A | Q | Y | L | E | V | K | C | G | A | M | I | L | K | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | R | M | E | E | L | K | I | L | S | D | T | Y | T | V | E | K | V | E | V | H | R | L | I | R | D | R | L | E | G | A | I | H | L | Q | E | Q | D | M | E | N | S | R | Q | V | L | N | S | Y | E | V | L | G | E | E | F | D | R | L | V | K | E | Y | T | V | L | K | Q | A | T | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | N | K | R | W | A | L | Q | E | F | S | K | V | Y | R | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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