|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c7qvgU_ | 3.30 | PDB header: plant protein | Chain: U: PDB Molecule: mpn domain-containing protein; |
Added to library: Sat Aug 20 09:24:15 2022 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | Q | I | F | S | S | K | S | I | E | K | V | V | V | H | P | L | V | L | L | S | I | V | D | H | Y | N | R | V | A | R | D | T | K | K | R | V | I | G | V | L | L | G | S | T | F | K | G | T | V | D | V | T | N | S | Y | A | V | P | F | E | E | D | D | K | D | S | S | I | W | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | D | H | N | Y | H | E | S | M | F | S | M | F | R | R | I | N | A | K | E | H | V | V | G | W | Y | S | T | G | P | K | L | R | E | N | D | L | D | V | H | R | L | F | S | D | Y | V | P | N | P | V | L | V | I | I | D | V | Q | P | E | E | L | G | I | P | T | K | A | Y | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | V | E | E | V | K | E | N | A | T | Q | K | S | Q | K | V | F | V | H | V | P | S | E | I | A | A | H | E | V | E | E | I | G | V | E | H | L | L | R | D | V | K | D | T | T | I | S | T | L | A | T | E | V | T | G | K | L | G | A | L | K | G | L | D | A | R | L | R | E | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | R | S | Y | L | E | L | V | I | Q | E | K | L | P | L | N | H | E | I | L | Y | H | L | Q | D | V | F | N | L | L | P | N | L | S | V | L | E | L | V | K | A | F | A | V | K | T | N | D | M | M | L | V | I | Y | L | S | S | L | I | R | S | V | I | A | L | H | N | L | I | N | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | K | M | L | N | K | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|