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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7qpiA_ | 2.50 | PDB header: transcription | Chain: A: PDB Molecule: vitamin d receptor; |
Added to library: Sat Dec 17 09:08:03 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Q | L | L | E | E | Q | E | R | L | I | A | T | L | I | E | A | H | R | K | T | Y | D | A | S | Y | S | D | F | S | Q | F | R | P | P | K | R | L | S | M | L | P | H | L | A | D | L | V | S | Y | S | I | Q | K | V | I | G | F | A | K | M | I | P | G | F | K | E | L | C | T | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | G | G | S | T | T | T | S | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | Q | I | S | L | L | K | A | S | A | I | E | I | I | I | L | R | S | N | E | S | F | T | M | E | D | N | S | W | T | C | G | S | N | E | F | K | Y | Q | I | G | D | V | M | Q | A | G | H | K | L | E | L | L | E | P | L | V | K | F | Q | V | N | M | K | K | L | D | L | H | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | T | S | S | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | E | H | V | L | L | M | A | I | C | L | F | S | P | D | R | P | G | V | Q | D | R | C | R | V | E | E | V | Q | E | H | L | T | E | T | L | R | A | Y | I | A | C | R | H | P | L | S | C | K | H | M | L | Y | T | K | M | V | E | K | L | T | E | L | R | S | L | N | E | E | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | S | K | Q | Y | L | Q | I | S | Q | D | A | V | N | K | E | D | L | P | P | L | L | L | E | V | F | G | N | P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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