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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7pbmB_ | 3.20 | PDB header: hydrolase | Chain: B: PDB Molecule: holliday junction atp-dependent dna helicase ruvb; |
Added to library: Sat Sep 17 08:56:22 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | L | R | P | Q | Y | F | K | E | Y | I | G | Q | D | K | V | K | D | Q | L | K | I | F | I | E | A | A | K | L | R | D | E | A | L | D | H | T | L | L | F | G | P | P | G | L | G | K | T | T | M | A | F | V | I | A | N | E | M | G | V | N | L | K | Q | T | S | G | P | A | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | S | T | T | S | T | T | S | S | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | K | A | G | D | L | V | A | I | L | N | D | L | E | P | G | D | I | L | F | I | D | E | I | H | R | M | P | M | A | V | E | E | V | L | Y | S | A | M | E | D | Y | Y | I | D | I | M | I | G | A | G | E | T | S | R | S | V | H | L | D | L | P | P | F | T | L | V | G | A | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | T | G | G | G | S | S | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | R | A | G | M | L | S | N | P | L | R | A | R | F | G | I | N | G | H | M | E | Y | Y | E | L | P | D | L | T | E | I | V | E | R | T | S | E | I | F | E | M | T | I | T | P | E | A | A | L | E | L | A | R | R | S | R | G | T | P | R | I | A | N | R | L | L | K | R | V | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | S | T | T | S | T | T | B | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | D | Y | A | Q | I | M | G | D | G | V | I | D | D | K | I | A | D | Q | A | L | T | M | L | D | V | D | H | E | G | L | D | Y | V | D | Q | K | I | L | R | T | M | I | E | M | Y | G | G | G | P | V | G | L | G | T | L | S | V | N | I | A | E | E | R | E | T | V | E | D | M | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | B | T | T | T | T | T | S | T | T | B | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | ||||||||||||||||||||
Sequence | E | P | Y | L | I | Q | K | G | F | I | M | R | T | R | T | G | R | V | A | T | A | K | A | Y | E | H | M | G | Y | D | Y | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T |
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