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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7lirB_ | 2.60 | PDB header: signaling protein | Chain: B: PDB Molecule: alk tyrosine kinase receptor homolog scd-2; |
Added to library: Sat Nov 27 08:29:44 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | D | L | F | I | N | T | C | G | A | S | G | F | E | Q | P | Q | N | C | D | H | H | F | L | K | E | D | G | T | Q | Q | W | T | V | P | V | T | G | F | Y | R | X | E | I | C | G | A | G | G | G | S | N | S | K | A | S | G | D | T | G | D | C | V | T | L | Q | V | H | L | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | B | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | N | L | S | L | R | X | L | I | G | Q | X | G | E | S | P | C | F | T | E | H | D | D | E | L | R | P | S | S | C | S | K | I | S | H | N | Y | V | Y | D | G | K | R | G | A | A | G | G | G | A | T | L | L | T | V | E | K | D | L | W | N | V | V | A | G | G | G | A | G | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | W | D | G | F | D | X | E | V | G | Y | G | A | S | A | I | H | V | K | P | D | Q | R | C | N | E | T | C | K | A | V | S | H | T | D | F | I | V | E | R | R | D | N | R | C | P | G | E | K | G | E | S | T | V | F | G | G | F | G | G | G | G | N | S | C | G | X | L | G | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | B | B | S | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | S | G | G | G | G | G | G | B | T | T | T | B | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | S | G | A | G | Y | Q | A | G | N | P | F | G | K | S | R | A | R | S | G | S | S | N | V | S | I | D | F | S | K | S | P | I | Y | Y | Q | S | E | R | L | D | E | G | Y | I | K | I | A | F | C | R | K | R | C | E | P | P | T | V | C | R | F | R | K | D | Y | F | E | E | E | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | T | T | S | G | G | G | G | S | T | T | T | S | S | S | S | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . |
Sequence | C | G | C | P | D | G | S | N | V | T | D | T | E | E | A | C | A | F | P | L | V | C | P | S | S | S | T | N | Q | Y | R | N | F | T | Y | E | P | F | C | L | C | N | N | G | K | E | I | Y | D | V | Y | N | D | T | C | E | ||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S | S | B | S | S | S |
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