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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7lbfD_ | 2.80 | PDB header: viral protein/immune system | Chain: D: PDB Molecule: isoform 3 of platelet-derived growth factor receptor alpha; |
Added to library: Sat Mar 13 09:21:57 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | P | S | I | L | P | N | E | N | E | K | V | V | Q | L | N | S | S | F | S | L | R | C | F | G | E | S | E | V | S | W | Q | Y | P | M | S | S | D | V | E | I | R | N | E | E | N | N | S | G | L | F | V | T | V | L | E | V | S | S | A | S | A | A | H | T | G | L | Y | T | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | B | T | T | B | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | Y | N | H | T | Q | T | E | E | N | E | L | E | G | R | H | I | Y | I | Y | V | P | D | P | D | V | A | F | V | P | L | G | M | T | D | Y | L | V | I | V | E | D | D | D | S | A | I | I | P | C | R | T | T | D | P | E | T | P | V | T | L | H | N | S | E | G | V | V | P | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | S | S | S | S | S | B | S | S | S | T | T | S | B | S | S | S | S | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | Y | D | S | R | Q | G | F | N | G | T | F | T | V | G | P | Y | I | C | E | A | T | V | K | K | K | F | Q | T | I | P | F | N | V | Y | A | L | K | A | T | S | E | L | D | L | E | M | E | A | L | K | T | V | Y | K | S | G | E | T | I | V | V | T | C | A | V | F | N | N | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . |
Sequence | V | V | D | L | Q | W | T | Y | P | G | E | V | K | G | K | G | I | T | M | L | E | E | I | K | V | P | S | I | K | L | V | Y | T | L | T | V | P | E | A | T | V | K | D | S | G | D | Y | E | C | A | A | R | Q | K | E | M | K | K | V | T | I | S | V | H | ||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | T | S | S | S | S | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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