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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7k5nA_ | 1.80 | PDB header: signaling protein | Chain: A: PDB Molecule: sensor domain-containing diguanylate cyclase; |
Added to library: Sat Aug 21 08:22:45 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | R | S | L | Q | R | E | L | Q | Q | R | L | L | A | T | N | H | Q | L | R | H | V | F | I | E | P | Y | L | N | E | M | E | R | Q | F | S | L | I | Y | D | Q | I | K | V | E | D | I | S | G | P | R | L | R | N | T | D | S | Y | L | R | E | W | R | L | Y | K | G | V | M | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | T | S | S | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | L | I | Y | I | Y | V | G | T | A | E | R | Q | M | L | I | Y | P | E | W | Q | A | D | A | D | F | D | P | R | V | R | P | W | Y | Q | L | A | S | Q | H | V | G | K | M | V | W | T | E | P | Y | Y | D | Y | T | N | G | T | L | V | I | A | L | A | R | A | I | T | D | K | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | G | G | G | S | T | T | T | T | S | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | K | V | R | G | V | F | A | V | D | A | I | L | A | P | F | S | A | Q | L | N | R | Q | W | N | S | G | Y | Q | M | I | V | N | Q | S | G | K | V | L | A | H | P | D | P | S | Q | L | L | K | P | M | T | H | P | T | W | L | S | R | F | S | G | E | D | G | I | F | L | D | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | T | T | S | B | S | S | G | G | G | T | T | S | B | S | G | G | G | G | G | G | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||
Sequence | A | S | R | Q | F | V | A | Y | S | R | L | P | D | H | N | W | V | L | I | S | V | L | P | A | S | S | I | P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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