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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7jn7B_ | 3.30 | PDB header: immune system, hydrolase | Chain: B: PDB Molecule: caspase recruitment domain-containing protein 8; |
Added to library: Sat May 22 08:32:47 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | N | V | D | V | E | L | I | D | K | S | T | N | R | Y | S | V | W | F | P | T | A | G | W | Y | L | W | S | A | T | G | L | G | F | L | V | R | D | E | V | T | V | T | I | A | F | G | S | W | S | Q | H | L | A | L | D | L | Q | H | H | E | Q | W | L | V | G | G | P | L | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | B | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | V | T | A | E | P | E | E | A | V | A | E | I | H | L | P | H | F | I | S | L | Q | A | G | E | V | D | V | S | W | F | L | V | A | H | F | K | N | E | G | M | V | L | E | H | P | A | R | V | E | P | F | Y | A | V | L | E | S | P | S | R | I | A | S | G | T | R | L | S | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T | B | B | S | S | B | B | S | B | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | P | I | T | S | N | T | L | I | Y | Y | H | P | H | P | E | D | I | K | F | H | L | Y | L | V | P | S | D | A | L | L | T | K | A | I | D | D | E | E | D | R | F | H | G | V | R | L | Q | T | S | P | P | M | E | P | L | N | F | G | S | S | Y | I | V | S | N | S | A | N | L | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | T | T | G | G | G | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . |
Sequence | V | M | P | K | E | L | K | L | S | Y | R | S | P | G | E | I | Q | H | F | S | K | F | Y | A | G | Q | M | K | E | P | I | Q | L | E | I | T | E | K | R | H | G | T | L | V | W | D | T | E | V | K | P | V | D | L | Q | L | V | A | A | S | A | P | ||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | S | S | S | B | B | S | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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