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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7eebA_ | 2.90 | PDB header: protein transport | Chain: A: PDB Molecule: enhanced green fluorescent protein,cation channel sperm- |
Added to library: Sat Jul 31 08:49:58 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | L | G | L | Q | Q | M | I | L | S | L | T | Q | S | L | G | F | E | T | F | I | F | I | V | V | C | L | N | T | V | I | L | V | A | Q | T | F | T | E | L | E | I | R | G | E | W | Y | F | M | V | L | D | S | I | F | L | S | I | Y | V | L | E | A | V | L | K | L | I | A | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | L | E | Y | F | Y | D | P | W | N | N | L | D | F | F | I | M | V | M | A | V | L | D | F | V | L | L | Q | I | N | S | L | S | Y | S | F | Y | N | H | S | L | F | R | I | L | K | V | F | K | S | M | R | A | L | R | A | I | R | V | L | R | R | L | S | I | L | T | S | L | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S | S | S | G | G | G | G | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | V | A | G | T | L | S | G | S | L | P | S | I | T | A | I | L | T | L | M | F | T | C | L | F | L | F | S | V | V | L | R | A | L | F | Q | D | S | D | P | K | R | F | Q | N | I | F | T | T | L | F | T | L | F | T | M | L | T | L | D | D | W | S | L | I | Y | I | D | N | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||
Sequence | A | Q | G | A | W | Y | I | I | P | I | L | M | I | Y | I | V | I | Q | Y | F | I | F | L | N | L | V | I | A | V | L | V | D | N | F | Q | M | A | L | L | K | G | L | E | K | V | K | L | E | ||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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