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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7e32R_ | 2.90 | PDB header: signaling protein | Chain: R: PDB Molecule: soluble cytochrome b562,5-hydroxytryptamine receptor 1d; |
Added to library: Sat Apr 24 09:28:14 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | Q | A | L | K | I | S | L | A | V | V | L | S | V | I | T | L | A | T | V | L | S | N | A | F | V | L | T | T | I | L | L | T | R | K | L | H | T | P | A | N | Y | L | I | G | S | L | A | T | T | D | L | L | V | S | I | L | V | M | P | I | S | I | A | Y | T | I | T | H | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | W | N | F | G | Q | I | L | C | D | I | W | L | S | S | D | I | T | C | C | T | A | S | I | W | H | L | C | V | I | A | L | D | R | Y | W | A | I | T | D | A | L | E | Y | S | K | R | R | T | A | G | H | A | A | T | M | I | A | I | V | W | A | I | S | I | C | I | S | I | P | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | F | W | R | D | C | L | V | N | T | S | Q | I | S | Y | T | I | Y | S | T | C | G | A | F | Y | I | P | S | V | L | L | I | I | L | Y | G | R | I | Y | R | A | A | R | N | R | I | L | N | P | P | S | L | Y | G | K | R | F | S | A | L | E | R | K | R | I | S | A | A | R | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | R | K | A | T | K | I | L | G | I | I | L | G | A | F | I | I | C | W | L | P | F | F | V | V | S | L | V | L | P | I | C | R | D | S | C | W | I | H | P | A | L | F | D | F | F | T | W | L | G | Y | L | N | S | L | I | N | P | I | I | Y | T | V | F | N | E | E | F | R | Q | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | F | Q | K | I | V | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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