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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7dwoA_ | 2.61 | PDB header: dna binding protein | Chain: A: PDB Molecule: predicted dna-binding transcriptional regulator; |
Added to library: Sat Jul 10 12:25:49 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | N | V | E | S | K | W | L | E | D | F | L | V | L | A | K | V | K | N | F | S | Q | A | A | E | L | R | N | V | T | Q | P | A | F | S | R | R | I | R | L | L | E | D | T | V | G | A | E | L | V | D | R | K | S | K | P | I | E | L | T | P | S | G | K | L | F | R | I | T | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | T | L | V | N | Q | I | E | A | G | I | S | Q | I | S | D | L | S | Q | L | G | G | N | V | V | Q | V | A | A | A | H | S | L | A | T | S | L | I | P | K | M | Q | Q | A | F | D | E | G | D | Y | K | P | I | L | S | V | E | A | I | D | V | D | E | A | T | K | E | L | R | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | A | C | D | I | L | L | A | F | D | D | D | I | L | R | L | P | P | Y | Q | S | Q | L | I | A | K | T | E | L | L | P | V | S | A | C | D | E | M | G | K | P | I | Y | D | F | I | S | Q | G | A | V | P | W | L | T | Y | S | S | T | S | Y | I | G | R | Q | V | E | I | I | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | T | T | S | B | T | T | S | B | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | S | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | E | Q | V | A | L | T | P | I | F | S | S | S | M | T | D | M | L | K | I | L | V | L | N | K | Q | G | I | A | W | L | P | A | Y | S | I | Q | E | E | L | A | Q | K | K | V | A | I | I | G | E | Q | S | L | R | L | P | I | E | Y | Y | A | Y | R | Y | Q | A | R | L | H | P | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | S | S | T | T | S | B | G | G | G | S | T | T | S | S | G | G | G | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | G | E | K | V | W | S | I | L | C | N | L | D | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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