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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7dtkA_ | 1.85 | PDB header: rna binding protein | Chain: A: PDB Molecule: atp-dependent rna helicase cgh-1; |
Added to library: Sat Mar 20 09:09:52 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | E | F | E | D | F | C | L | G | R | D | L | L | M | G | I | F | E | K | G | W | E | K | P | S | P | I | Q | E | A | S | I | G | V | A | L | T | G | Q | D | I | L | A | R | A | K | N | G | T | G | K | T | G | A | Y | C | I | P | V | I | E | K | I | Q | P | A | L | K | A | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | T | T | S | T | T | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | A | M | V | I | V | P | T | R | E | L | A | L | Q | T | S | Q | I | C | V | E | L | S | K | H | I | Q | L | K | V | M | V | T | T | G | G | T | D | L | R | D | D | I | M | R | L | N | G | T | V | H | L | V | I | A | T | P | G | R | I | L | D | L | M | E | K | G | V | A | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . |
Sequence | M | E | H | C | K | T | L | V | L | D | E | A | D | K | L | L | S | Q | D | F | Q | G | I | L | D | R | L | I | N | F | L | P | K | E | R | Q | V | M | L | Y | S | A | T | F | P | N | T | V | T | S | F | M | Q | K | H | M | H | K | P | Y | E | I | N | |||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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