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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7dp3A_ | 2.55 | PDB header: dna binding protein | Chain: A: PDB Molecule: dna helicase mcm8; |
Added to library: Sat May 22 09:52:19 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | Y | K | G | W | K | L | Y | F | S | E | V | Y | S | D | S | S | P | L | I | E | K | I | Q | A | F | E | K | F | F | T | R | H | I | D | L | Y | D | K | D | E | I | E | R | K | G | S | I | L | V | D | F | K | E | L | T | E | G | G | E | V | T | N | L | I | P | D | I | A | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | T | S | S | T | T | S | T | T | G | G | G | S | T | S | S | S | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | L | R | D | A | P | E | K | T | L | A | C | M | G | L | A | I | H | Q | V | L | T | K | D | L | E | R | H | A | A | E | L | Q | A | Q | T | M | V | N | V | P | H | I | H | A | R | V | Y | N | Y | E | P | L | T | Q | L | K | N | V | R | A | N | Y | Y | G | K | Y | I | A | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | B | G | G | G | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | G | T | V | V | R | V | S | N | I | K | P | L | C | T | K | M | A | F | L | C | A | A | C | G | E | I | Q | S | F | P | L | P | D | G | K | Y | S | L | P | T | K | C | P | V | P | V | C | R | G | R | S | F | T | A | L | R | S | S | P | L | T | V | T | M | D | W | Q | S | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | K | I | Q | E | L | M | S | D | D | Q | R | E | A | G | R | I | P | R | T | I | E | C | E | L | V | H | D | L | V | D | S | C | V | P | G | D | T | V | T | I | T | G | I | V | K | V | S | N | A | N | D | K | C | M | F | L | L | Y | I | E | A | N | S | I | S | N | S | K | ||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | G | G | G | T | T | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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