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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7db6D_ | 3.30 | PDB header: signaling protein | Chain: D: PDB Molecule: melatonin receptor type 1a; |
Added to library: Sat Aug 21 09:20:20 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | R | P | S | W | L | A | S | A | L | A | C | V | L | I | F | T | I | V | V | D | I | L | G | N | L | L | V | I | L | S | V | Y | R | N | K | K | L | R | N | A | G | N | I | F | V | V | S | L | A | V | A | D | L | V | V | A | I | Y | P | Y | P | L | V | L | M | S | I | F | N | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | W | N | L | G | Y | L | H | C | Q | V | S | G | F | L | M | G | L | S | V | I | G | S | I | F | N | I | T | G | I | A | I | N | R | Y | C | Y | I | C | H | S | L | K | Y | D | K | L | Y | S | S | K | N | S | L | C | Y | V | L | L | I | W | L | L | T | L | A | A | V | L | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | S | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | L | R | A | G | T | L | Q | Y | D | P | R | I | Y | S | C | T | F | A | Q | S | V | S | S | A | Y | T | I | A | V | V | V | F | H | F | L | V | P | M | I | I | V | I | F | C | Y | L | R | I | W | I | L | V | L | Q | V | R | Q | R | V | P | Q | D | F | R | N | F | V | T | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . |
Sequence | F | V | V | F | V | L | F | A | I | C | W | A | P | L | N | F | I | G | L | A | V | A | S | D | P | A | S | M | V | P | R | I | P | E | W | L | F | V | A | S | Y | Y | M | A | Y | F | N | S | C | L | N | A | I | I | Y | G | L | L | N | Q | N | F | R | K | E | Y | ||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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