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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7ccgA_ | 1.85 | PDB header: cell invasion | Chain: A: PDB Molecule: dna-directed rna polymerase subunit delta; |
Added to library: Sat Sep 12 08:41:51 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | I | I | A | Y | L | S | D | I | G | N | H | D | E | A | H | A | L | G | K | G | L | I | K | T | I | A | P | G | A | E | I | V | D | I | T | H | Q | V | T | P | F | D | V | R | E | G | G | L | Y | L | Q | D | V | P | A | S | F | P | A | N | T | V | I | A | A | Y | V | Y | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | T | G | T | S | T | R | T | V | V | V | R | N | E | K | G | Q | L | L | V | A | P | N | N | G | L | L | T | W | A | L | K | A | V | P | A | V | E | A | W | E | V | T | S | P | D | V | M | N | Q | P | V | T | P | T | W | Y | G | K | D | V | V | V | A | C | G | A | H | L | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | S | G | G | G | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | G | V | A | P | S | A | V | G | P | K | I | D | V | A | K | L | V | T | L | P | T | T | P | A | V | Q | L | G | D | G | S | V | R | G | E | V | V | R | I | D | K | A | F | G | N | V | W | T | N | I | S | L | D | A | L | S | G | K | T | L | Q | V | T | A | E | G | L | S | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | G | S | G | G | G | S | S | S | S | T | T | T | T | G | G | G | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . |
Sequence | E | I | P | Y | Y | A | T | F | G | E | V | P | I | G | E | P | L | V | Y | N | N | S | R | G | K | V | A | L | G | L | N | Q | G | S | F | L | E | R | Y | G | V | A | A | G | D | T | V | T | I | G | L | V | M | |||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | G | G | G | S | T | T | T | T | S | T | T | B | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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