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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7c4jH_ | 2.89 | PDB header: dna binding protein | Chain: H: PDB Molecule: transcription regulatory protein snf2; |
Added to library: Sat Jul 18 09:06:38 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | P | K | P | Q | K | P | V | P | L | N | V | L | Q | D | Q | Y | K | E | G | I | K | V | V | D | I | D | D | P | D | M | M | V | D | S | F | T | M | P | N | I | S | H | S | N | I | D | Y | Q | T | L | L | A | N | S | D | H | A | K | F | T | I | E | P | G | V | L | P | V | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | S | T | S | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | D | T | H | T | A | T | D | I | Y | Q | T | L | I | A | L | N | L | D | T | T | V | N | D | C | L | D | K | L | L | N | D | E | C | T | E | S | T | R | E | N | A | L | Y | D | Y | Y | A | L | Q | L | L | P | L | Q | K | A | V | R | G | H | V | L | Q | F | E | W | H | Q | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | L | L | T | N | T | H | P | N | F | L | S | K | I | R | N | I | N | V | Q | D | A | L | L | T | N | Q | L | Y | K | N | H | E | L | L | K | L | E | R | K | K | T | E | A | V | A | R | L | K | S | M | N | K | S | A | I | N | Q | Y | N | R | R | Q | D | K | K | N | K | R | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | K | F | G | H | R | L | I | A | T | H | T | N | L | E | R | D | E | Q | K | R | A | E | K | K | A | K | E | R | L | Q | A | L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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