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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7bmhB_ | 2.20 | PDB header: membrane protein | Chain: B: PDB Molecule: opsin; |
Added to library: Sat Jul 10 08:37:29 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | I | Y | E | T | V | G | D | S | G | S | K | T | L | W | V | V | F | V | L | M | L | I | A | S | A | A | F | T | A | L | S | W | K | I | P | V | N | R | R | L | Y | H | V | I | T | T | I | I | T | L | T | A | A | L | S | Y | F | A | M | A | T | G | H | G | V | A | L | N | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | G | G | G | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | V | I | R | T | Q | H | D | T | Y | E | T | V | Y | R | Q | V | Y | Y | A | R | Y | I | D | W | A | I | T | T | P | L | L | L | L | D | L | G | L | L | A | G | M | S | G | A | H | I | F | M | A | I | V | A | D | L | I | M | V | L | T | G | L | F | A | A | F | G | S | E | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | P | Q | K | W | G | W | Y | T | I | A | C | I | A | Y | I | F | V | V | W | H | L | V | L | N | G | G | A | N | A | R | V | K | G | E | K | L | R | S | F | F | V | A | I | G | A | Y | T | L | I | L | W | T | A | Y | P | I | V | W | G | L | A | D | G | A | R | K | I | G | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | D | G | E | I | I | A | Y | A | V | L | D | V | L | A | G | V | F | G | A | W | L | L | V | T | H | A | N | L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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