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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7b2rB_ | 1.60 | PDB header: ligase | Chain: B: PDB Molecule: tripartite motif-containing protein 2; |
Added to library: Sat Jan 16 09:02:36 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | I | E | D | D | L | I | F | R | V | G | T | K | G | R | N | K | G | E | F | T | N | L | Q | G | V | A | A | S | T | N | G | K | I | L | I | A | D | S | N | N | Q | C | V | Q | I | F | S | N | D | G | Q | F | K | S | R | F | G | I | R | G | R | S | P | G | Q | L | Q | R | P | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S | B | S | S | S | T | T | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | V | A | V | H | P | S | G | D | I | I | I | A | D | Y | D | N | K | W | V | S | I | F | S | S | D | G | K | F | K | T | K | I | G | S | G | K | L | M | G | P | K | G | V | S | V | D | R | N | G | H | I | I | V | V | D | N | K | A | C | C | V | F | I | F | Q | P | N | G | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | V | T | R | F | G | S | R | G | N | G | D | R | Q | F | A | G | P | H | F | A | A | V | N | S | N | N | E | I | I | I | T | D | F | H | N | H | S | V | K | V | F | N | Q | E | G | E | F | M | L | K | F | G | S | N | G | E | G | N | G | Q | F | N | A | P | T | G | V | A | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | T | T | B | S | S | T | T | G | G | G | T | T | T | S | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . |
Sequence | D | S | N | G | N | I | I | V | A | D | W | G | N | S | R | I | Q | V | F | D | G | S | G | S | F | L | S | Y | I | N | T | S | A | D | P | L | Y | G | P | Q | G | L | A | L | T | S | D | G | H | V | V | V | A | D | S | G | N | H | C | F | K | V | Y | |||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S | G | G | G | T |
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