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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7aslO_ | 4.50 | PDB header: viral protein | Chain: O: PDB Molecule: gag protein; |
Added to library: Sat Jun 26 08:44:01 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | H | Q | A | I | S | P | R | T | L | N | A | W | V | K | V | V | E | E | K | A | F | S | P | E | V | I | P | M | F | S | A | L | S | E | G | A | T | P | Q | D | L | N | T | M | L | N | T | V | G | G | H | Q | A | A | M | Q | M | L | K | E | T | I | N | E | E | A | A | E | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | R | V | H | P | V | H | A | G | P | I | A | P | G | Q | M | R | E | P | R | G | S | D | I | A | G | T | T | S | T | L | Q | E | Q | I | G | W | M | T | N | N | P | P | I | P | V | G | E | I | Y | K | R | W | I | I | L | G | L | N | K | I | V | R | M | Y | S | P | T | S | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | D | I | R | Q | G | P | K | E | P | F | R | D | Y | V | D | R | F | Y | K | T | L | R | A | E | Q | A | S | Q | E | V | K | N | W | M | T | E | T | L | L | V | Q | N | A | N | P | D | C | K | T | I | L | K | A | L | G | P | A | A | T | L | E | E | M | M | T | A | C | Q | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | T | S | T | T | S | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||
Sequence | V | G | G | P | G | H | K | A | R | V | L | A | E | A | M | S | Q | V | I | N | S | A | T | I | M | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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