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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7aodO_ | 4.50 | PDB header: transcription | Chain: O: PDB Molecule: dna-directed rna polymerases i and iii subunit rpac1; |
Added to library: Sat Feb 27 08:22:14 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Y | Y | F | D | E | D | N | I | W | D | L | D | K | F | K | K | N | L | K | V | S | I | T | S | L | D | Q | E | T | M | V | F | E | I | S | G | I | D | A | S | I | A | N | A | F | R | R | I | L | I | A | E | I | P | T | L | A | F | E | F | V | Y | I | I | N | N | T | S | I | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | D | E | V | L | S | H | R | I | G | L | V | P | I | S | A | D | P | D | M | F | K | W | F | Q | H | P | L | P | G | Q | E | A | T | H | T | D | Y | D | T | V | V | F | S | L | N | K | K | C | E | F | N | K | N | A | A | T | D | E | K | D | P | K | R | L | Y | V | N | S | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | T | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | Y | S | G | D | L | I | W | K | P | Q | G | R | Q | E | E | R | F | A | D | N | P | I | R | V | V | N | P | D | I | V | V | A | K | L | R | P | G | Q | E | I | D | L | E | A | H | A | I | L | G | I | G | Q | D | H | A | K | F | S | P | V | A | T | A | S | Y | R | L | L | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | S | S | B | S | T | T | T | T | T | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | T | I | H | I | L | S | P | I | E | G | E | D | A | V | K | F | Q | K | C | F | P | K | G | V | I | E | L | E | E | G | P | D | G | K | K | Q | A | R | V | A | D | V | R | K | D | T | V | S | R | E | C | L | R | H | P | E | F | A | D | K | V | Q | L | G | R | V | R | D | H | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | T | G | G | G | S | T | G | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||
Sequence | L | F | S | V | E | S | T | G | I | M | K | P | D | V | L | F | I | K | S | I | A | V | L | K | S | K | C | L | A | V | K | S | S | L | Q | N | I | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S |
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