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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6zzy7_ | 3.16 | PDB header: photosynthesis | Chain: 7: PDB Molecule: chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic; |
Added to library: Sat Jul 31 08:38:50 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | R | E | L | W | F | P | G | N | K | E | V | V | P | D | Y | L | D | G | S | L | V | G | D | H | G | F | D | P | L | G | L | G | S | S | P | E | Q | L | S | W | N | V | H | A | E | I | F | H | G | R | L | A | M | T | G | V | A | G | I | L | L | T | S | L | L | H | K | G | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | D | V | P | E | W | F | E | A | G | R | V | Y | L | D | R | N | P | N | V | D | F | G | A | L | L | F | S | T | I | V | M | S | G | F | V | E | F | K | R | L | N | D | I | R | N | P | G | S | Q | G | S | G | I | L | P | E | D | F | K | G | V | G | G | P | Q | G | R | T | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | T | T | S | T | T | S | S | S | S | T | T | S | G | G | G | G | B | G | G | G | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | G | P | Y | V | G | G | R | Y | F | D | P | M | G | L | C | R | G | S | P | E | Q | T | L | K | Y | K | W | N | E | I | R | N | G | R | L | A | M | M | A | F | L | G | F | A | A | Q | Y | A | A | T | G | K | G | P | I | D | N | L | V | D | H | V | A | D | P | F | H | T | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | F | V | H | N | G | V | S | V | P | F | I | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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