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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6za3A_ | 2.05 | PDB header: transcription | Chain: A: PDB Molecule: transcriptional regulator, gntr family; |
Added to library: Sat Dec 5 09:50:35 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | T | H | G | G | R | A | V | I | E | L | R | E | K | I | L | S | G | E | L | P | G | G | M | R | L | F | E | V | S | T | A | E | L | L | D | I | S | R | T | P | V | R | E | A | L | S | R | L | T | E | E | G | L | L | N | R | L | P | G | G | G | F | V | V | R | R | F | G | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | B | T | S | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | D | V | V | D | A | I | E | V | R | G | V | M | E | G | T | A | A | R | L | A | A | E | R | G | V | S | K | V | A | L | E | E | I | D | A | T | V | Q | Q | L | D | L | C | F | G | D | R | V | D | D | V | D | F | D | G | Y | A | A | L | N | R | I | F | H | H | Q | L | A | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | S | S | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | C | G | S | E | M | I | R | R | E | V | E | R | A | S | S | L | P | F | A | S | P | S | A | F | L | P | D | K | A | N | I | G | A | F | R | R | S | L | R | G | A | Q | E | Q | H | K | A | I | V | A | A | I | V | A | R | E | G | A | R | A | E | A | V | A | R | E | H | S | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | G | G | G | S | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||
Sequence | T | A | R | T | N | L | E | Y | M | I | R | E | A | P | E | L | I | A | Q | V | P | G | L | A | L | I | S | D | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | T | T | S | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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