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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6yzgA_ | 1.40 | PDB header: cell adhesion | Chain: A: PDB Molecule: surface-associated protein cshb; |
Added to library: Sat May 29 08:56:34 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | W | L | D | F | S | D | S | A | S | W | K | N | L | D | Q | R | G | G | L | K | V | G | T | T | F | T | K | E | I | S | P | G | Y | V | V | T | L | T | V | K | E | L | K | P | F | N | S | T | E | I | Y | K | K | R | V | A | G | T | A | T | E | G | T | Y | D | P | D | A | E | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | T | T | S | T | T | T | T | G | G | G | S | T | T | S | T | T | G | G | G | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | F | L | T | S | A | P | Y | Y | G | K | T | P | P | P | S | V | T | G | A | A | Q | Q | K | R | K | T | Q | L | V | Y | P | M | N | S | T | N | W | G | V | K | F | D | I | E | A | T | Y | L | G | K | R | V | A | P | T | V | V | M | A | D | G | E | D | A | N | P | G | E | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | T | S | B | S | T | G | G | G | B | S | S | S | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | I | F | T | T | N | G | T | G | W | E | Y | M | G | E | W | K | M | A | Y | N | V | I | T | K | K | M | L | D | D | E | D | V | K | R | R | G | L | L | I | L | K | D | K | S | V | D | W | Y | K | Y | L | S | P | D | T | V | T | G | G | L | G | S | Q | V | F | G | P | N | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | T | T | S | G | G | G | G | S | S | T | T | T | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | S | N | E | R | T | V | P | V | V | M | T | R | G | A | S | E | V | G | F | Y | V | A | S | S | G | Q | Q | A | M | M | M | G | F | L | V | V | A | V | S | D | A | P | E | S | Y | G | E | A | F | H | T | I | S | T | R | D | S | V | T | N | D | P | I | N | Q | P | Y | L | G | |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S | T | S | T | T | T | S |
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