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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6yxoA_ | 2.00 | PDB header: signaling protein | Chain: A: PDB Molecule: swi/snf complex subunit smarcc1; |
Added to library: Sat Apr 24 08:54:20 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | L | A | V | Y | R | R | K | D | G | G | P | A | T | K | F | W | E | S | P | E | T | V | S | Q | L | D | S | V | R | V | W | L | G | K | H | Y | K | K | Y | V | H | A | D | A | P | T | N | K | T | L | A | G | L | V | V | Q | L | L | Q | F | Q | E | D | A | F | G | K | H | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | S | S | S | S | T | S | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | N | P | A | F | T | K | L | P | A | K | C | F | X | D | F | K | A | G | G | A | L | C | H | I | L | G | A | A | Y | K | Y | K | N | E | Q | G | W | R | R | F | D | L | Q | N | P | S | R | X | D | R | N | V | E | X | F | X | N | I | E | K | T | L | V | Q | N | N | C | L | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | G | G | G | G | G | S | T | T | S | T | S | S | S | S | G | G | G | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | P | N | I | Y | L | I | P | D | I | D | L | K | L | A | N | K | L | K | D | I | I | K | R | H | Q | G | T | F | T | D | E | K | S | K | A | S | H | H | I | Y | P | Y | S | E | W | L | R | P | V | X | R | K | E | K | Q | V | L | V | H | W | G | F | Y | P | D | S | Y | D | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | G | G | G | S | T | T | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 |
Sequence | W | V | H | S | N | D | V | D | A | E | I | E | D | P | P | I | P | E | K | P | W | K | V | H | V | K | W | I | L | D | T | D | I | F | N | E | W | X | N | E | E | D | Y | E | V | D | E | N | R | K | P | V | S | F | R | Q | R | I | S | T | ||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | T | T | S | G | G | G | G | B | B | T | T | S | B | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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