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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6ywfA_ | 1.90 | PDB header: lyase | Chain: A: PDB Molecule: alginate lyase (pl7); |
Added to library: Sat May 15 08:29:35 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Y | T | A | P | S | T | E | S | K | F | T | E | V | L | S | K | A | K | L | Q | Y | P | T | S | T | T | V | A | F | A | D | D | L | L | D | G | Y | A | A | S | Y | F | Y | L | T | S | D | L | Y | M | Q | F | Q | V | A | G | S | S | Q | R | S | E | L | R | E | M | E | T | S | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | G | G | G | T | S | S | S | S | T | T | B | T | T | T | T | S | S | T | T | B | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | E | A | A | W | D | C | T | G | S | T | A | H | V | A | S | A | Q | I | A | I | P | V | Q | E | D | G | I | E | E | V | T | I | L | Q | V | H | D | S | D | V | T | P | V | L | R | I | S | W | V | S | S | I | T | I | D | G | V | T | S | E | D | V | V | L | A | T | I | R | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | S | S | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | I | D | D | S | T | A | T | K | T | V | L | Q | A | H | T | T | S | R | T | E | F | N | I | N | V | Q | N | S | K | L | S | I | T | V | D | G | T | T | E | L | D | E | A | D | I | S | Q | F | D | G | S | T | C | Y | F | K | A | G | A | Y | N | N | N | P | T | D | T | S | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | T | G | G | G | T | T | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | N | A | R | I | K | M | Y | E | L | E | W | V | D | H | H | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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