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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6xp5H_ | 4.20 | PDB header: transcription | Chain: H: PDB Molecule: mediator of rna polymerase ii transcription subunit 8; |
Added to library: Sat Mar 6 08:37:28 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | P | E | E | L | K | Q | L | E | L | L | R | N | R | F | A | Q | L | Q | S | S | L | T | S | L | A | G | N | L | I | R | T | E | P | L | P | T | Y | E | S | L | Q | A | S | A | S | I | L | Q | Q | N | L | R | S | I | Q | E | L | M | T | E | N | S | D | I | F | K | R | I | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | H | P | S | T | N | F | P | G | R | T | Q | E | H | M | L | L | Q | L | L | R | K | K | L | E | P | E | V | E | S | W | V | E | E | A | R | E | T | A | R | A | F | N | E | Q | W | A | D | M | L | E | T | F | Q | H | S | L | H | H | Y | V | T | V | Q | L | K | K | Q | Y | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T | G | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | V | E | E | Q | E | M | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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