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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6xp5F_ | 4.20 | PDB header: transcription | Chain: F: PDB Molecule: mediator of rna polymerase ii transcription subunit 6; |
Added to library: Sat Mar 6 08:39:05 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | D | E | I | Q | W | H | T | N | P | A | V | V | G | G | S | I | H | D | N | S | V | L | F | Y | F | R | E | S | P | F | Y | D | K | T | S | N | N | E | V | L | Y | Q | Q | G | L | H | N | Q | T | M | M | Q | F | L | E | T | L | R | E | M | S | G | L | E | F | V | V | A | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S | S | G | G | G | T | T | S | S | T | T | T | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | T | G | T | G | V | W | V | I | N | K | Q | T | R | R | K | E | D | E | I | S | V | H | G | T | Y | F | L | V | G | E | N | V | Y | M | A | A | P | T | L | A | D | I | I | S | M | R | L | A | S | A | S | S | S | I | S | R | L | L | P | I | A | A | S | V | Q | S | W | S | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | S | B | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | P | D | P | R | W | L | E | E | T | L | M | I | H | E | F | F | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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