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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6xkcD_ | 2.03 | PDB header: ligase | Chain: D: PDB Molecule: protein fem-1 homolog c; |
Added to library: Sat Oct 17 09:36:33 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | L | K | T | A | V | F | N | A | A | R | D | G | K | L | R | L | L | T | K | L | L | A | S | K | S | K | E | E | V | S | S | L | I | S | E | K | T | N | G | A | T | P | L | L | M | A | A | R | Y | G | H | L | D | M | V | E | F | L | L | E | Q | C | S | A | S | I | E | V | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | T | T | S | B | T | T | B | T | T | T | T | S | G | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | S | V | N | F | D | G | E | T | I | E | G | A | P | P | L | W | A | A | S | A | A | G | H | L | K | V | V | Q | S | L | L | N | H | G | A | S | V | N | N | T | T | L | T | N | S | T | P | L | R | A | A | C | F | D | G | H | L | E | I | V | K | Y | L | V | E | H | K | A | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | E | V | S | N | R | H | G | H | T | C | L | M | I | S | C | Y | K | G | H | K | E | I | A | Q | Y | L | L | E | K | G | A | D | V | N | R | K | S | V | K | G | N | T | A | L | H | D | C | A | E | S | G | S | L | D | I | M | K | M | L | L | M | Y | C | A | K | M | E | K | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | ||||||||||||||||||||||
Sequence | G | Y | G | M | T | P | L | L | S | A | S | V | T | G | H | T | N | I | V | D | F | L | T | H | H | A | Q | T | S | K | T | E | R | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | G | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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