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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6xjiD_ | 4.00 | PDB header: membrane protein | Chain: D: PDB Molecule: abc transporter atp-binding protein; |
Added to library: Sat Oct 17 10:30:58 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | K | L | E | H | I | T | K | K | Y | G | S | N | V | V | L | N | D | I | D | F | D | F | G | D | S | R | I | V | G | L | I | G | K | N | G | V | G | K | T | T | V | M | K | V | M | N | G | N | I | I | K | F | D | G | K | V | D | I | D | N | A | D | N | I | G | F | L | I | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | S | T | S | S | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | H | P | K | L | Y | D | N | K | S | G | L | Y | N | L | K | L | F | A | Q | V | L | G | K | G | F | D | K | A | Y | T | D | K | I | I | D | A | F | G | M | R | P | Y | I | K | K | K | V | K | K | Y | S | M | G | M | K | Q | K | L | A | I | A | V | S | L | M | N | K | P | K | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | B | T | S | S | S | T | G | G | G | T | T | S | B | G | G | G | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | I | L | D | E | P | T | N | G | M | D | P | D | G | S | I | D | V | L | T | T | I | K | S | L | V | N | E | L | D | M | R | I | L | I | S | S | H | K | L | E | D | I | E | L | I | C | D | R | A | V | F | L | R | D | G | H | F | V | Q | D | V | N | M | E | E | G | V | A | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | D | T | T | I | V | T | V | D | H | K | D | F | D | R | T | E | K | Y | L | A | E | H | F | Q | L | Q | N | V | D | K | A | D | G | H | L | M | I | N | A | Q | K | N | Y | Q | V | I | L | K | A | L | S | E | L | D | I | Y | P | K | Y | I | E | T | R | K | S | S | L | R | D | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | T | T | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | Y | F | N | I | N | Q | R | G | D | K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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