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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6wveA_ | 2.43 | PDB header: membrane protein | Chain: A: PDB Molecule: green fluorescent protein,chicken signal peptidase complex |
Added to library: Sat Jan 16 08:30:07 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | E | E | L | F | T | G | V | V | P | I | L | V | E | L | D | G | D | V | N | G | H | K | F | S | V | R | G | E | G | E | G | D | A | T | N | G | K | L | T | L | K | F | I | C | T | T | G | K | L | P | V | P | W | P | T | L | V | T | T | L | V | Q | C | F | S | R | Y | P | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | G | G | G | G | T | T | T | G | G | G | S | B | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | H | M | K | R | H | D | F | F | K | S | A | M | P | E | G | Y | V | Q | E | R | T | I | S | F | K | D | D | G | T | Y | K | T | R | A | E | V | K | F | E | G | D | T | L | V | N | R | I | E | L | K | G | I | D | F | K | E | D | G | N | I | L | G | H | K | L | E | Y | N | V | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T | T | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | V | F | R | S | I | P | T | D | Y | K | G | Q | K | L | A | E | Q | I | F | Q | G | I | I | L | V | S | A | V | I | G | F | I | Y | G | Y | V | T | E | Q | F | G | W | T | V | Y | I | V | M | A | G | F | A | V | S | C | L | L | T | L | P | P | W | P | M | Y | R | R | N | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | L | N | S | H | N | V | Y | I | T | A | D | K | Q | K | N | G | I | K | A | N | F | K | I | R | H | N | V | E | D | G | S | V | Q | L | A | D | H | Y | Q | Q | N | T | P | I | G | D | G | P | V | L | L | P | D | N | H | Y | L | S | T | Q | S | V | L | S | K | D | P | N | E | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | B | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | R | D | H | M | V | L | L | E | F | V | T | A | A | G | I | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S |
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