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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6whbA_ | 1.90 | PDB header: signaling protein | Chain: A: PDB Molecule: mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1; |
Added to library: Sat Aug 29 08:27:51 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Q | I | P | P | A | Y | K | D | L | A | E | P | W | I | Q | V | F | G | M | E | L | V | G | C | L | F | S | R | N | W | N | V | R | E | M | A | L | R | R | L | S | H | D | V | S | G | A | L | L | L | A | N | S | G | D | V | V | E | A | C | C | S | V | L | S | M | V | C | A | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | V | Y | K | V | Y | V | A | A | L | K | T | L | R | A | M | L | V | Y | T | P | C | H | S | L | A | E | R | I | K | L | Q | R | L | L | Q | P | V | V | D | T | I | L | V | K | C | A | D | A | N | S | R | T | S | Q | L | S | I | S | T | L | L | E | L | C | K | G | Q | A | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | T | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | L | A | V | G | R | E | I | G | S | I | G | I | G | G | V | D | Y | V | L | N | C | I | L | G | N | Q | T | E | S | N | N | W | Q | E | L | L | G | R | L | C | L | I | D | R | L | L | L | E | F | P | A | E | F | Y | P | H | I | V | S | T | E | P | V | E | I | R | Y | K | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | S | S | G | G | G | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | L | L | S | L | L | T | F | A | L | Q | S | I | D | N | S | H | S | M | V | G | K | L | S | R | R | I | Y | L | S | S | A | R | M | V | T | T | V | P | H | V | F | S | K | L | L | E | M | L | S | V | S | S | S | T | H | F | T | R | M | R | R | R | L | M | A | I | A | D | E | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | T | T | T | S | T | T | S | S | T |   | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | E | I | A | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
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