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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6w1sV_ | 4.02 | PDB header: gene regulation | Chain: V: PDB Molecule: mediator of rna polymerase ii transcription subunit 27; |
Added to library: Sat Mar 13 08:33:53 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | V | N | L | E | A | F | S | Q | A | I | S | A | I | Q | A | L | R | S | S | V | S | R | V | F | D | C | L | K | D | G | M | R | N | K | E | T | L | E | G | R | E | K | A | F | I | A | N | F | Q | D | N | L | H | S | V | N | R | D | L | N | E | L | E | R | L | S | N | L | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | K | P | S | E | N | H | P | L | H | N | S | G | L | L | S | L | D | P | Y | S | Q | L | L | Q | A | Y | K | W | S | N | K | L | Q | Y | H | A | G | L | A | S | G | L | L | N | Q | Q | S | L | K | R | S | A | N | P | Q | Y | V | D | D | V | I | S | R | I | D | R | M | F | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | M | S | I | H | L | S | R | P | N | G | T | S | A | M | L | L | V | T | L | G | K | V | L | K | V | I | V | V | M | R | S | L | F | I | D | R | T | I | V | K | G | Y | N | T | E | D | G | K | L | D | I | W | S | K | S | S | Y | Q | V | F | Q | K | V | T | D | H | A | T | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | B | S | T | T | B | B | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . |
Sequence | A | L | L | H | Y | Q | L | P | Q | M | P | D | V | V | V | R | S | F | M | T | W | L | R | S | Y | I | K | L | F | Q | A | P | C | Q | R | C | G | K | F | L | Q | D | G | L | P | P | T | W | R | D | F | R | T | L | E | A | ||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | G | G | G | G | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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