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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6vrpB_ | 1.60 | PDB header: protein binding | Chain: B: PDB Molecule: single-chain fv; |
Added to library: Sat Feb 13 09:09:47 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | V | Q | L | V | E | S | G | G | G | L | V | Q | P | G | G | S | L | R | L | S | C | A | A | S | G | F | S | L | S | T | S | G | I | G | V | T | W | V | R | Q | A | P | G | K | G | L | E | W | L | A | T | I | W | W | D | D | D | N | R | Y | A | D | S | V | K | G | R | F | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | G | G | G | T | T | T | T | S | T | T | T | G | G | G | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | S | A | D | T | S | K | N | T | A | Y | L | Q | M | N | S | L | T | A | E | D | T | A | V | Y | Y | C | A | Q | S | A | I | T | S | V | T | D | S | A | M | D | H | W | G | Q | G | T | L | V | T | V | S | S | G | G | G | G | S | D | I | Q | M | T | Q | S | P | S | S | L | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | S | G | G | G | S | B | T | T | B | B | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | S | V | G | D | R | V | T | I | T | C | R | A | S | Q | D | I | S | S | Y | L | N | W | Y | Q | Q | K | P | G | K | A | P | K | L | L | I | Y | Y | T | S | S | L | H | S | G | V | P | S | R | F | S | G | S | R | S | G | T | D | F | T | L | T | I | S | S | L | Q | P | E | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||
Sequence | F | A | T | Y | Y | C | Q | Q | Y | S | K | F | P | W | T | F | G | Q | G | T | K | V | E | I | K | G | S | H | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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