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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6umaA_ | 1.60 | PDB header: ligase | Chain: A: PDB Molecule: e3 ubiquitin-protein ligase trim7; |
Added to library: Sat Apr 17 09:20:26 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | K | V | E | L | T | L | D | P | D | T | A | N | P | R | L | I | L | S | L | D | L | K | G | V | R | L | G | E | R | A | Q | D | L | P | N | H | P | R | F | D | T | N | T | R | V | L | A | S | G | F | S | S | G | R | H | H | W | E | V | E | V | G | S | K | D | G | W | A | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | B | G | G | G | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | B | B | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | V | A | R | E | S | V | R | R | K | G | L | T | P | F | T | P | E | E | G | V | W | A | L | Q | L | N | G | G | Q | Y | W | A | V | T | S | P | E | R | S | P | L | S | C | G | H | L | S | R | V | R | V | A | L | D | L | E | V | G | A | V | S | F | Y | A | V | E | D | M | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | G | G | G | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||
Sequence | H | L | Y | T | F | R | V | N | F | Q | E | R | V | F | P | L | F | S | V | S | T | G | T | Y | L | R | I | W | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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