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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6u5jD_ | 3.50 | PDB header: antimicrobial protein | Chain: D: PDB Molecule: collar pa0615; |
Added to library: Sat Apr 18 08:23:31 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Q | A | V | T | L | E | A | L | Y | A | A | I | E | Q | V | L | R | E | R | L | P | E | A | Q | L | I | G | F | W | P | G | V | P | E | N | T | P | A | V | S | L | E | I | A | E | L | L | P | E | R | D | P | G | T | G | E | S | A | L | L | C | R | L | Q | A | R | I | M | V | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | G | A | D | R | Q | A | V | S | I | A | C | G | I | V | R | T | L | R | E | Q | T | W | N | L | S | L | Q | P | A | R | F | V | R | S | A | V | D | G | S | R | E | E | L | K | S | L | R | V | W | L | V | E | W | T | Q | S | L | R | L | G | D | P | E | W | A | W | E | D | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||
Sequence | P | P | G | S | L | M | L | G | F | D | P | Q | T | G | P | G | H | E | P | D | Y | F | A | P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | G | G | G | S | T | T | S | T | T | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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