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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6u5hC_ | 4.00 | PDB header: unknown function | Chain: C: PDB Molecule: probable bacteriophage protein pyocin r2; |
Added to library: Sat Apr 18 08:26:02 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | Q | P | S | F | R | I | V | A | D | G | T | D | V | T | Q | R | L | N | D | R | L | L | K | L | T | L | L | D | K | P | G | M | E | S | D | S | L | T | L | R | I | D | D | R | D | G | Q | V | A | L | P | R | R | G | A | V | L | E | V | H | L | G | Y | A | G | E | P | L | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | B | S | S | S | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | M | G | R | F | T | V | D | T | L | Q | W | A | G | P | P | D | C | L | T | V | T | A | K | A | G | D | M | R | G | S | G | K | T | I | R | S | G | G | W | E | G | T | T | L | A | Q | V | C | R | D | V | G | A | R | N | G | W | R | V | E | C | P | L | Q | V | A | I | A | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | D | Q | V | N | E | S | D | Y | H | F | V | T | R | L | A | R | Q | Y | D | C | T | A | K | L | A | E | G | M | L | M | V | L | P | R | Q | S | G | Q | S | A | T | G | R | R | I | E | P | L | V | L | G | R | A | D | V | G | S | F | D | V | T | F | D | D | R | S | L | M | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | B | T | G | G | G | B | S | S | S | S | S | S | S | B | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | T | V | K | T | R | Y | Q | L | P | V | E | L | K | N | P | K | A | P | A | T | A | M | G | E | H | V | D | R | H | L | Y | T | S | R | G | E | A | E | Q | A | A | K | A | R | L | A | S | F | S | R | S | S | A | S | V | R | L | E | L | P | G | R | G | D | L | F | A | E | R | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G | T | T | T | T | T | B | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||
Sequence | L | L | L | Q | G | F | K | A | G | I | D | G | E | F | L | I | D | S | V | E | H | T | Y | S | S | S | G | W | T | T | V | V | Q | C | N | G | G | R | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | S | S |
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