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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6t9kB_ | 3.30 | PDB header: gene regulation | Chain: B: PDB Molecule: transcription factor spt20; |
Added to library: Sat Feb 1 08:22:40 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | R | P | K | R | L | Y | N | F | V | E | D | A | D | S | I | L | K | K | Y | E | Q | Y | L | H | S | F | E | F | H | I | Y | E | N | N | Y | K | I | C | A | P | A | G | L | I | L | T | K | N | N | E | T | L | K | E | F | L | E | Y | V | A | R | G | R | I | P | D | A | I | M | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | G | G | G | T | T | T | T | B | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | L | R | D | C | N | I | Q | F | Y | E | G | N | L | I | L | Q | V | Y | D | H | T | N | T | V | D | V | R | P | R | V | Y | R | T | L | L | K | P | N | D | L | T | T | Y | Y | D | M | M | S | Y | A | D | N | A | R | F | S | D | S | I | Y | Q | Q | F | E | S | E | I | L | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | B | T | T | B | S | T | T | B | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | |||||||||||||||
Sequence | L | T | K | R | N | L | S | L | S | V | P | L | N | P | Y | E | H | R | D | M | L | E | E | T | A | F | S | E | P | H | W | D | S | E | K | K | S | F | I | H | E | |||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | G | G | G | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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