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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6swy4_ | 3.20 | PDB header: ligase | Chain: 4: PDB Molecule: vacuolar import and degradation protein 24; |
Added to library: Sat Nov 23 08:25:00 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | R | K | K | Y | I | V | E | D | Q | S | P | Y | S | S | E | N | P | V | I | V | T | S | S | Y | N | H | T | V | C | T | N | Y | L | R | P | R | M | Q | F | T | G | Y | Q | I | S | G | Y | K | R | Y | Q | V | T | V | N | L | K | T | V | D | L | P | K | K | D | C | T | S | L | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | S | B | S | S | T | T | T | T | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | H | L | S | G | F | L | S | I | R | G | P | E | I | S | T | Y | F | E | A | Y | A | V | N | H | K | E | L | G | F | L | S | S | S | W | K | D | E | P | V | L | N | E | F | K | A | T | D | Q | T | D | L | E | H | W | I | N | F | P | S | F | R | Q | L | F | I | S | R | I | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | Q | E | K | Q | F | D | N | Y | L | N | E | R | F | I | F | M | K | W | K | E | K | F | L | V | P | D | A | S | Y | D | G | F | Y | Y | I | V | H | D | Q | V | T | G | N | I | Q | G | F | Y | Y | H | Q | D | A | E | K | F | Q | Q | L | E | L | V | P | S | L | V | E | S | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | S | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | D | C | S | F | E | F | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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