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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6sskG_ | 3.18 | PDB header: viral protein | Chain: G: PDB Molecule: endogenous retrovirus group k member 24 gag polyprotein; |
Added to library: Sat Jan 4 08:14:31 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | V | T | L | E | P | V | E | A | R | Y | K | S | F | S | I | K | M | L | K | D | M | K | E | G | V | K | Q | Y | G | P | N | S | P | Y | M | R | T | L | L | D | S | I | A | H | G | H | R | L | I | P | Y | D | W | E | I | L | A | K | S | S | L | S | P | S | Q | F | L | Q | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | T | W | W | I | D | G | V | Q | E | Q | V | R | R | N | R | A | A | N | P | P | V | N | I | D | A | D | Q | L | L | G | I | G | Q | N | W | S | T | I | S | Q | Q | A | L | M | Q | N | E | A | I | E | Q | V | R | A | I | C | L | R | A | W | E | K | I | Q | D | P | G | S | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | C | P | S | F | N | T | V | R | Q | G | S | K | E | P | Y | P | D | F | V | A | R | L | Q | D | V | A | Q | K | S | I | A | D | E | K | A | R | K | V | I | V | E | L | M | A | Y | E | N | A | N | P | E | C | Q | S | A | I | K | P | L | K | G | K | V | P | A | G | S | D | V | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | T | S | G | G | G | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | S | E | Y | V | K | A | C | D | G | I | G | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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