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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6se1A_ | 1.08 | PDB header: transferase | Chain: A: PDB Molecule: putative lipopolysaccharide modification acyltransferase; |
Added to library: Sat Aug 29 08:30:33 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | E | Y | A | S | V | T | D | V | Y | N | Y | Y | K | Y | G | E | L | L | R | G | G | I | C | H | S | V | Q | L | T | A | A | I | S | N | G | C | I | K | N | G | K | H | N | I | F | I | I | G | D | S | Y | A | A | A | L | F | N | G | L | S | H | Y | I | D | N | K | G | S | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | B | T | T | T | B | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | I | I | S | Q | M | T | D | G | N | A | P | P | L | F | V | D | G | K | D | D | L | Q | R | S | V | I | T | L | N | N | N | R | I | N | E | I | K | R | V | Q | P | E | V | V | L | L | T | W | S | V | R | G | T | N | G | V | H | D | K | K | L | A | I | D | A | L | S | L | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | B | T | T | S | B | S | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | K | K | I | K | E | A | S | P | D | S | R | I | I | F | I | G | P | V | P | E | W | N | A | N | L | V | K | I | I | S | N | Y | L | S | E | F | K | K | T | P | P | L | Y | M | T | Y | G | L | N | S | E | I | S | E | W | D | S | Y | F | S | N | N | V | P | K | M | G | I | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | S | S | S | S | S | T | T | B | S | S | G | G | G | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . |
Sequence | Y | I | S | A | Y | K | A | L | C | N | E | S | G | C | L | T | R | V | G | N | G | P | D | F | I | T | A | V | D | W | G | H | L | T | K | P | G | S | D | F | L | F | N | K | I | G | N | K | I | I | K | |||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | S | S | S | S | G | G | G | B | S | B | S | S | S | S | B | G | G | G | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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