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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6rumA_ | 1.60 | PDB header: protein binding | Chain: A: PDB Molecule: gfp-lama-g97 a gfp enhancer nanobody with cpdhfr insertion; |
Added to library: Sat Feb 15 08:35:15 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Q | V | Q | L | V | E | S | G | G | A | L | V | Q | P | G | G | S | L | R | L | S | C | A | A | S | G | F | P | V | N | R | Y | S | M | R | W | Y | R | Q | A | P | G | K | E | R | E | W | V | A | G | M | S | S | A | G | D | R | S | S | Y | E | D | S | V | K | G | R | F | T | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | G | G | G | S | T | T | S | T | T | S | S | T | T | T | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | R | D | D | A | R | N | T | V | Y | L | Q | M | N | S | L | K | P | E | D | T | A | V | Y | Y | C | N | V | N | V | G | L | P | A | D | L | A | W | F | K | R | N | T | L | N | K | P | V | I | M | G | R | H | T | W | E | S | I | G | R | P | L | P | G | R | K | N | I | I | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | G | G | G | B | T | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | S | Q | P | G | T | D | D | R | V | T | W | V | K | S | V | D | E | A | I | A | A | C | G | D | V | P | E | I | M | V | I | G | G | G | R | V | Y | E | Q | F | L | P | K | A | Q | K | L | Y | L | T | H | I | D | A | E | V | E | G | D | T | H | F | P | D | Y | E | P | D | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | S | T | S | S | G | G | G | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . |
Sequence | W | E | S | V | F | S | E | F | H | D | A | D | A | Q | N | S | H | S | Y | C | F | E | I | L | E | R | R | G | G | G | M | I | S | L | I | A | A | L | A | V | D | R | V | I | G | M | E | N | A | M | P | W | N | F | E | Y | W | G | Q | G | T | Q | V | T | V | S | ||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | S | S | S | G | G | G | B | T | T | B | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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