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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6rpqA_ | 2.65 | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: ubiquitin-like protein smt3,1108aa long hypothetical cell |
Added to library: Sat Aug 17 08:23:20 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | T | H | I | N | L | K | V | S | D | G | S | S | E | I | F | F | K | I | K | K | T | T | P | L | R | R | L | M | E | A | F | A | K | R | Q | G | K | E | M | D | S | L | R | F | L | Y | D | G | I | R | I | Q | A | D | Q | T | P | E | D | L | D | M | E | D | N | D | I | I | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S | G | G | G | S | S | S | S | B | S | S | T | G | G | G | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | H | R | E | Q | I | G | G | S | G | K | A | V | D | Y | D | T | E | V | L | L | G | D | G | R | K | R | K | I | G | E | I | V | E | E | A | I | K | K | A | E | K | E | G | K | L | G | R | V | D | D | G | F | Y | A | P | I | N | L | E | L | Y | A | L | D | V | R | T | L | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | T | T | B | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | R | K | V | K | A | D | I | A | W | K | R | T | T | P | E | K | M | L | R | I | R | T | K | R | G | R | E | I | R | V | T | P | T | H | P | F | F | T | L | E | E | G | R | I | K | T | K | K | A | Y | E | L | K | V | G | E | K | I | A | T | P | R | E | E | A | P | E | A | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | T | T | G | G | G | T | T | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||
Sequence | I | F | W | D | E | V | V | E | I | E | E | Y | K | P | N | N | S | W | V | Y | D | L | Q | V | P | E | H | H | N | F | I | A | N | G | I | F | V | H | N | |||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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