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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6rapE_ | 3.30 | PDB header: virus like particle | Chain: E: PDB Molecule: afp16; |
Added to library: Sat Apr 20 08:19:40 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | N | Y | Q | T | L | V | D | V | N | N | A | M | N | K | M | L | R | A | Y | V | N | E | A | V | A | I | R | F | D | L | P | D | T | Q | A | D | A | A | I | S | V | F | L | Y | D | I | H | E | D | L | Q | L | R | T | A | E | S | R | G | F | N | A | G | A | G | R | L | L | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | S | S | S | B | G | G | G | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | W | V | N | V | K | C | N | Y | L | I | T | Y | W | E | S | P | D | S | Q | P | D | N | Q | A | I | Q | V | M | S | Q | V | L | A | A | L | I | N | N | R | Q | L | A | D | I | G | A | Y | T | Q | V | M | P | P | K | E | N | L | N | S | L | G | N | F | W | Q | S | L | G | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | P | R | L | S | L | N | Y | C | V | T | V | P | I | S | L | S | D | K | G | E | E | M | T | P | V | K | S | L | S | T | T | V | E | P | K | A | P | L | S | P | L | V | I | T | D | A | L | R | E | Q | L | R | V | A | L | D | A | C | L | A | M | T | H | V | N | L | D | S | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | G | G | G | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . |
Sequence | P | V | A | N | S | D | G | S | A | A | E | I | R | V | S | L | R | V | Y | G | M | T | P | T | E | Y | L | A | P | M | N | T | V | F | N | E | W | E | K | S | E | A | A | A | V | T | P | D | G | Y | R | V | Y | I | N | A | V | D | K | T | D | L | T | G | I | |||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | B | B | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S | T | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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