|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c6r89B_ | 2.50 | PDB header: membrane protein | Chain: B: PDB Molecule: glutamate receptor 3.3,glutamate receptor 3.3; |
Added to library: Sat Jan 4 08:39:36 2020 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | E | L | K | I | G | V | P | L | R | V | S | Y | K | E | F | V | S | Q | I | R | G | T | E | N | M | F | K | G | F | C | I | D | V | F | T | A | A | V | N | L | L | P | Y | A | V | P | V | K | F | I | P | Y | G | N | G | K | E | N | P | S | Y | T | H | M | V | E | M | I | T | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | S | S | S | T | S | S | S | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | N | F | D | G | V | V | G | D | V | A | I | V | T | N | R | T | K | I | V | D | F | T | Q | P | Y | A | A | S | G | L | V | V | V | A | P | G | G | T | P | I | K | G | I | E | S | L | R | E | R | D | D | P | I | G | Y | Q | V | G | S | F | A | E | S | Y | L | R | N | E | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | B | T | T | S | S | S | B | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | I | S | E | S | R | L | V | P | L | G | T | P | E | A | Y | A | K | A | L | K | D | G | P | S | K | G | G | V | A | A | I | V | D | E | R | P | Y | V | E | L | F | L | S | S | N | C | A | Y | R | I | V | G | Q | E | F | T | K | S | G | W | G | F | A | F | P | R | D | S | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | T | G | G | G | T | S | T | T | T | S | S | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||
Sequence | L | A | I | D | L | S | T | A | I | L | E | L | A | E | N | G | D | L | Q | R | I | H | D | K | W | L | M | C | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|