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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6r24D_ | 7.50 | PDB header: virus like particle | Chain: D: PDB Molecule: transposon ty3-i gag-pol polyprotein; |
Added to library: Sat May 11 08:13:49 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | S | H | K | L | K | N | F | I | S | E | I | M | L | N | M | S | M | I | S | W | P | N | D | A | S | R | I | V | Y | C | R | R | H | L | L | N | P | A | A | Q | W | A | N | D | F | V | Q | E | Q | G | I | L | E | I | T | F | D | T | F | I | Q | G | L | Y | Q | H | F | Y | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | P | D | I | N | K | I | F | N | A | I | T | Q | L | S | E | A | K | L | G | I | E | R | L | N | Q | R | F | R | K | I | W | D | R | M | P | P | D | F | M | T | E | K | A | A | I | M | T | Y | T | R | L | L | T | K | E | T | Y | N | I | V | R | M | H | K | P | E | T | L | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | D | A | M | E | E | A | Y | Q | T | T | A | L | T | E | R | F | F | P | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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