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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6qph2_ | 3.40 | PDB header: photosynthesis | Chain: 2: PDB Molecule: lhc2; |
Added to library: Sat Feb 15 08:33:56 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | D | R | P | L | W | S | P | G | S | E | P | P | A | W | L | D | G | S | L | A | G | D | Y | G | F | D | P | L | H | L | S | E | E | P | E | M | R | K | W | M | V | Q | A | E | L | V | H | C | R | W | A | M | L | G | V | A | G | I | L | F | T | S | I | G | A | K | A | G | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | F | P | D | W | Y | D | A | G | K | E | L | Q | K | N | S | D | I | P | L | G | S | L | I | F | T | E | L | L | L | F | G | W | V | E | T | K | R | L | Y | D | L | R | N | P | G | S | Q | G | D | G | S | F | L | G | I | T | D | G | L | K | G | K | E | N | G | Y | P | G | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | F | D | P | M | G | M | S | K | N | E | A | S | F | K | E | A | K | Q | K | E | V | K | N | G | R | L | A | M | L | A | F | V | G | F | I | A | Q | H | H | A | T | H | K | S | P | I | D | N | L | L | D | H | V | A | D | P | F | H | V | T | F | A | T | N | G | V | S | I | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | H | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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