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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6qm7V_ | 2.80 | PDB header: hydrolase | Chain: V: PDB Molecule: proteasome beta1 chain; |
Added to library: Sat Apr 20 08:20:41 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | T | I | L | A | V | S | Y | N | G | G | V | V | L | A | A | D | S | R | T | S | S | G | T | Y | V | V | N | R | A | S | N | K | L | T | K | L | T | K | K | I | Y | C | C | R | S | G | S | A | A | D | T | Q | A | L | A | E | R | V | S | N | Y | L | G | S | Y | Q | T | D | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | A | G | V | N | V | A | T | A | A | N | L | F | Q | K | M | C | Y | M | N | R | W | N | I | S | A | G | I | I | V | A | G | Y | D | P | I | N | G | G | S | V | Y | S | I | P | S | G | G | S | C | V | K | L | D | Y | A | L | G | G | S | G | S | I | F | L | Y | S | F | F | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | N | Y | K | P | G | M | S | K | S | E | C | V | A | F | C | Q | R | A | V | A | H | A | Y | S | R | D | G | S | S | G | G | L | I | R | T | I | T | L | D | A | D | E | P | E | D | Q | T | I | P | W | N | R | S | P | Y | C | M | E | K | D | P | K | Y | V | T | Q | A | T | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G | S | T | T | T | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | N | Q | P | F | S | S | S | A | K | I | T | G | N | R | M | S | S | T | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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