|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c6qk4B_ | 1.73 | PDB header: lyase | Chain: B: PDB Molecule: membrane-bound lytic murein transglycosylase a; |
Added to library: Sat Aug 17 08:24:44 2019 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | P | A | G | A | A | I | V | P | G | Q | I | A | A | A | R | L | T | P | V | A | W | Q | Q | V | P | G | W | Q | D | D | S | L | I | G | A | T | I | A | L | R | Q | N | C | A | R | L | A | R | Q | A | N | W | Q | R | A | C | A | A | A | M | R | L | D | D | L | D | V | G | S | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | S | S | S | G | G | G | S | T | T | G | G | G | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | T | F | F | E | T | Y | F | T | P | F | Q | F | A | N | N | D | G | T | L | D | G | L | V | T | G | Y | Y | E | P | L | L | H | G | S | R | V | R | R | G | P | Y | Q | Y | A | L | Y | R | W | P | A | G | Y | R | A | G | A | S | M | P | A | R | A | Q | L | M | R | S | G | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | B | S | S | B | T | T | B | S | S | S | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | S | G | N | E | L | V | W | V | D | D | P | I | E | A | F | F | L | Q | V | Q | G | S | G | R | V | V | L | D | D | G | T | V | M | R | V | G | Y | G | G | T | N | N | Q | P | Y | R | S | I | G | K | W | L | L | D | H | G | E | L | G | A | G | Q | A | T | M | Q | G | I | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | T | T | S | T | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | A | W | A | R | A | N | P | S | R | V | D | A | L | L | D | T | N | P | R | F | V | F | F | R | E | M | P | S | A | D | G | P | V | G | A | L | G | V | P | L | T | P | E | R | S | I | A | V | D | P | S | S | I | P | L | G | T | P | V | F | L | Q | T | T | R | P | M | T | N | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | S | B | T | T | S | S | B | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . |
Sequence | P | L | N | R | L | V | F | A | Q | D | V | G | T | A | I | K | G | G | V | R | A | D | Y | F | W | G | L | G | D | D | A | G | D | Q | A | G | R | M | K | Q | N | G | R | M | W | L | L | F | P | N | S | |||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|