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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6pzjA_ | 1.75 | PDB header: signaling protein | Chain: A: PDB Molecule: methyl-accepting chemotaxis protein; |
Added to library: Sat Aug 17 08:25:23 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | H | H | H | H | H | M | E | I | T | A | E | R | W | T | Y | E | V | K | D | Y | L | D | T | G | M | G | I | I | R | G | F | R | F | P | L | L | F | S | A | P | P | R | N | Q | I | I | A | A | L | R | E | I | L | K | V | N | D | H | Y | F | G | A | R | L | A | Y | E | P | N | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | D | G | N | D | L | E | F | Q | N | T | L | G | H | D | S | T | G | R | F | I | P | Y | L | H | R | G | Q | T | K | E | E | I | V | L | E | D | A | K | Y | Y | D | S | L | G | P | E | G | D | W | Y | Q | V | P | K | K | T | K | S | H | Y | A | T | D | P | Y | Y | Y | E | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | G | T | T | S | T | T | B | T | T | B | S | S | T | T | T | T | S | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | G | K | V | K | I | L | M | M | S | L | M | V | P | L | Y | V | N | D | Q | F | Y | G | V | A | G | L | D | Y | Q | L | E | E | L | Q | Q | R | I | G | V | K | K | P | F | Q | D | L | G | Y | L | T | L | I | S | P | K | G | I | Y | A | V | N | G | F | D | S | N | R | V | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | S | B | T | T | B | S | T | T | S | B | S | S | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . |
Sequence | E | K | I | S | D | A | K | E | L | E | Y | Y | L | S | K | S | Q | E | G | E | K | F | T | T | D | S | D | G | Y | T | H | Y | Y | F | P | F | H | I | G | K | D | K | R | Y | W | V | M | Q | V | S | I | P | N | S | ||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | T | T | S | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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