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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6py8F_ | 3.75 | PDB header: dna binding protein/dna | Chain: F: PDB Molecule: neurogenic locus notch homolog protein 1; |
Added to library: Sat Aug 17 08:55:32 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | R | R | R | Q | H | G | Q | L | W | F | P | E | G | F | K | V | S | E | V | N | V | R | G | P | D | G | F | T | P | L | M | I | A | S | C | S | E | E | D | A | P | A | V | I | S | D | F | I | Y | Q | G | A | S | L | H | N | Q | T | D | R | T | G | E | T | A | L | H | L | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | R | Y | S | R | S | D | A | A | K | R | L | L | E | A | S | A | D | A | N | I | Q | D | N | M | G | R | T | P | L | H | A | A | V | S | A | D | A | Q | G | V | F | Q | I | L | I | R | N | R | A | T | D | L | D | A | R | M | H | D | G | T | T | P | L | I | L | A | A | R | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | V | E | G | M | L | E | D | L | I | N | S | H | A | D | V | N | A | V | D | D | L | G | K | S | A | L | H | W | A | A | A | V | N | N | V | D | A | A | V | V | L | L | K | N | G | A | N | K | D | M | Q | N | N | R | E | E | T | P | L | F | L | A | A | R | E | G | S | Y | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | ||||
Sequence | T | A | K | V | L | L | D | H | F | A | N | R | D | I | T | D | H | M | D | R | L | P | R | D | I | A | Q | E | R | M | H | H | D | I | V | R | L | L | D | E | Y | N | L | V | ||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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